中央流行疫情指揮中心為了因應國內疫情，即時蒐集確診民眾與其密切接觸者資訊，並簡化衛生局疫調作業流程，5月1日起正式啟動「確診個案自主回報疫調系統」（自主回報系統），提供確診民眾專屬一次性網址連結回報密切接觸者資料，以便快速掌握密切接觸者資訊，由於連結是採簡訊方式發送，填寫者點選時可先留意幾個特點，以免點選到可疑的連結。
「確診個案自主回報疫調系統」上線 幾個重點確認是否官方連結
在中央版的「確診個案自主回報疫調系統」上線前，各地方政府如新北市先前有規劃地方版的自主回報疫調系統，不過隨著5月1日的「確診個案自主回報疫調系統」上線，就都改為統一使用中央的版本。
「確診個案自主回報疫調系統」為三個主要流程：確診者點選簡訊連結、進入系統填寫疫調資料、與系統發送處置指導訊息給公司或學校聯繫者。在「確診個案自主回報疫調系統」第一個流程中，是針對民眾採檢時或投保時所留存的手機號碼發送手機簡訊(簡訊顯示門號：0911514588)，提供確診民眾專屬一次性網址連結(網址開頭為https: //bbs.cdc.gov.tw/…… )，簡訊內容如下：「您為COVID-19確診個案，請前往自主回報系統網站並核對個人資料後，主動回報密切接觸者資料，並通知您工作或就學的聯絡窗口，謝謝您。https: //bbs.cdc.gov.tw/……」。在這個階段須留意兩個重點，一是簡訊顯示門號為「0911514588」；二是一次性連結為「https: //bbs.cdc.gov.tw/……」。
第二個流程為確診者進入系統填寫疫調資料，需輸入確診者或其法定代理人之身分證字號或居留證號碼後六碼進行身分驗證，並確認系統頁面顯示資料為確診者本人後，再開始填報同住者、公司或學校聯絡窗口等相關資料。此階段須留意的重點為：「系統不會要求確診民眾填寫完整的『姓名』、『身分證字號』或『居留證號碼』」，而且「確診民眾送出資料後，該一次性網址即會失效，將無法再進行編輯或再次填寫。」
中央流行疫情指揮中心也提到，「確診個案自主回報疫調系統」目前為第一階段的功能，第二階段將開發自動開立居家照護通知書與同住者開立居家隔離通知書等功能，且將提供透過「全民健保行動快易通APP」等其他可能方式，以利確診個案自主回報疫調資訊。
由於確診病例持續增加，為了降低基層作業的負擔與加速確診者密切接觸者資料的彙整，因此中樣正式上線了「確診個案自主回報疫調系統」，不過透過簡訊發送連結的方式，可能讓常見的簡訊詐騙有機可乘，因此我們也整理了簡訊顯示門號為「0911514588」、一次性連結為「https: //bbs.cdc.gov.tw/……」、資料填寫時不需填寫完整的『姓名』、『身分證字號』或『居留證號碼』、送出資料後一次性網址即會失效等填寫重點，若是之後收到簡訊通知表示資料填寫錯誤需重新登入填寫、或門號開頭為+886之類的狀況，就要留意可能是詐騙簡訊。